Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
VAMP3Q15836 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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