Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms