Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NPTX1Q15818 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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