Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
TAF1AQ15573 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms