Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SIX1Q15475 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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SIX1Q15475 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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SIX1Q15475 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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SIX1Q15475 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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SIX1Q15475 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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SIX1Q15475 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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SIX1Q15475 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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SIX1Q15475 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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