Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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SYCP1Q15431 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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SYCP1Q15431 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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SYCP1Q15431 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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