Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMCO1Q147U7 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMCO1Q147U7 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
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