Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
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UBE4AQ14139 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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UBE4AQ14139 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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UBE4AQ14139 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
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UBE4AQ14139 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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UBE4AQ14139 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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UBE4AQ14139 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
UBE4AQ14139 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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