| RUNX2 | Q13950 | LINC01495-202 | ENST00000534135 | 343 nt | TSL 2 BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC025575.1-201 | ENST00000548497 | 544 nt | TSL 4 BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC025254.1-201 | ENST00000550035 | 247 nt | TSL 5 BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL512360.1-201 | ENST00000555346 | 234 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01146-208 | ENST00000557355 | 548 nt | TSL 4 BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4474-201 | ENST00000579189 | 78 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC004542.2-201 | ENST00000602847 | 546 nt | TSL 3 BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007621.1-201 | ENST00000604544 | 437 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC002076.2-201 | ENST00000617362 | 122 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MAGI2-AS3-224 | ENST00000619135 | 205 nt | TSL 5 BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007998.5-201 | ENST00000622938 | 237 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND1P37-201 | ENST00000636562 | 264 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR3688-2-201 | ENST00000636963 | 87 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PLCZ1-209 | ENST00000539875 | 1398 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007785.2-201 | ENST00000598627 | 1916 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AGL-206 | ENST00000370165 | 7106 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KNTC1-204 | ENST00000436959 | 2412 nt | TSL 2 BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RHOT1-204 | ENST00000394692 | 2960 nt | TSL 2 BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PTPN22-211 | ENST00000538253 | 3575 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL021368.2-201 | ENST00000606125 | 5352 nt | BASIC | 3.32 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | WDR72-201 | ENST00000360509 | 5887 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MANEA-201 | ENST00000358812 | 4575 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AF117829.1-206 | ENST00000621883 | 3802 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AMY2B-208 | ENST00000610648 | 1736 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL7P26-201 | ENST00000333817 | 754 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA62.1-201 | ENST00000364287 | 154 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-741P-201 | ENST00000383889 | 107 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-483P-201 | ENST00000384088 | 108 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR218-2-201 | ENST00000385006 | 110 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL591416.1-201 | ENST00000404015 | 867 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU2-33P-201 | ENST00000410344 | 192 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC239803.1-203 | ENST00000411978 | 452 nt | TSL 2 BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS29P4-201 | ENST00000414733 | 161 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092047.1-201 | ENST00000424997 | 240 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMGN2P31-201 | ENST00000432430 | 273 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL7P54-201 | ENST00000438336 | 674 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC016691.1-201 | ENST00000441321 | 413 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC013269.3-201 | ENST00000450486 | 444 nt | TSL 3 BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NHS-AS1-201 | ENST00000452788 | 366 nt | TSL 3 BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC025518.1-201 | ENST00000479856 | 347 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC233702.1-201 | ENST00000482905 | 502 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL32P34-201 | ENST00000486380 | 400 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC108078.2-201 | ENST00000510750 | 236 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC016550.2-202 | ENST00000511940 | 581 nt | TSL 2 BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP471-201 | ENST00000516971 | 106 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC022360.2-202 | ENST00000517308 | 407 nt | TSL 3 BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009623.2-201 | ENST00000522524 | 465 nt | TSL 3 BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RGS5-206 | ENST00000527988 | 373 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP005435.4-201 | ENST00000529514 | 284 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL512310.1-201 | ENST00000548639 | 172 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL157687.1-201 | ENST00000554853 | 619 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC079203.2-201 | ENST00000559867 | 387 nt | TSL 2 BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007495.2-202 | ENST00000564102 | 535 nt | TSL 4 BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC025678.1-201 | ENST00000567861 | 338 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL133383.1-201 | ENST00000569292 | 901 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01894-201 | ENST00000580984 | 487 nt | TSL 2 BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC002115.1-201 | ENST00000589603 | 568 nt | TSL 4 BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC022601.1-201 | ENST00000596954 | 577 nt | TSL 4 BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MACROD2-IT1-202 | ENST00000605675 | 575 nt | TSL 5 BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC027045.1-201 | ENST00000609065 | 202 nt | TSL 5 BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC244093.3-201 | ENST00000615419 | 411 nt | TSL 3 BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL138880.2-201 | ENST00000616214 | 239 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC068831.7-201 | ENST00000616954 | 363 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL357559.1-201 | ENST00000622228 | 274 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092628.2-201 | ENST00000622492 | 339 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC011155.2-201 | ENST00000623202 | 216 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC025034.2-201 | ENST00000623264 | 286 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UBE2E2-207 | ENST00000628311 | 267 nt | TSL 5 BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND5P42-201 | ENST00000637720 | 498 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PKN2-AS1-202 | ENST00000458097 | 3542 nt | TSL 2 BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ADGRG2-206 | ENST00000360279 | 4702 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL161457.2-203 | ENST00000590767 | 2663 nt | TSL 5 BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CCDC141-202 | ENST00000409284 | 6960 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TPTE2P4-201 | ENST00000258589 | 1605 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FKTN-209 | ENST00000602661 | 2576 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PCDH11Y-201 | ENST00000215473 | 4595 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HSFY2-201 | ENST00000304790 | 1444 nt | APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HSFY1-201 | ENST00000307393 | 1444 nt | APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ANKRD36BP1-202 | ENST00000604892 | 1417 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL139276.1-201 | ENST00000311910 | 1001 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.9-201 | ENST00000362354 | 101 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNY4P14-201 | ENST00000363656 | 96 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1322P-201 | ENST00000364309 | 107 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-817P-201 | ENST00000391083 | 104 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS4XP3-201 | ENST00000398541 | 413 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC068533.1-201 | ENST00000418542 | 415 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | F10-AS1-201 | ENST00000424635 | 417 nt | TSL 5 BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ARF4P2-201 | ENST00000430209 | 526 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC018816.1-203 | ENST00000441894 | 338 nt | TSL 3 BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS24P13-201 | ENST00000442520 | 397 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | IGKV3D-7-201 | ENST00000443397 | 384 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DDX3P2-201 | ENST00000446138 | 111 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS29P31-201 | ENST00000446147 | 164 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | C6orf10-204 | ENST00000447241 | 2148 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL590664.1-201 | ENST00000448065 | 339 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMGB3P8-201 | ENST00000449709 | 577 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RBMY2UP-201 | ENST00000453474 | 324 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL133351.1-201 | ENST00000456189 | 417 nt | TSL 2 BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL162395.1-201 | ENST00000457882 | 422 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS29P15-201 | ENST00000458329 | 171 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |