Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.92
ITGA9Q13797 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms