Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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TUBB3Q13509 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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TUBB3Q13509 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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TUBB3Q13509 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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TUBB3Q13509 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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TUBB3Q13509 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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TUBB3Q13509 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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