Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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