Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NME3Q13232 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NME3Q13232 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NME3Q13232 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NME3Q13232 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NME3Q13232 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NME3Q13232 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NME3Q13232 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NME3Q13232 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NME3Q13232 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
NME3Q13232 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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NME3Q13232 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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NME3Q13232 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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NME3Q13232 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NME3Q13232 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NME3Q13232 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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NME3Q13232 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NME3Q13232 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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NME3Q13232 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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NME3Q13232 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NME3Q13232 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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NME3Q13232 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NME3Q13232 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NME3Q13232 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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NME3Q13232 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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NME3Q13232 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NME3Q13232 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NME3Q13232 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NME3Q13232 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NME3Q13232 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
NME3Q13232 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
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