Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms