Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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