Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PRDM2Q13029 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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PRDM2Q13029 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
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PRDM2Q13029 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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PRDM2Q13029 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
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PRDM2Q13029 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
PRDM2Q13029 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
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