Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BPTFQ12830 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.9 ms