Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RBBP4Q09028 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms