Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPEQ02224 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC0.51□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CENPEQ02224 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms