Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 UNC5D-206ENST00000453357 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 AC005518.2-201ENST00000603254 282 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 CR382285.1-202ENST00000604687 547 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 ZNF708-201ENST00000356929 4004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 Z99129.3-201ENST00000624363 6430 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 CEP57L1-214ENST00000521277 3832 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 AC105046.1-201ENST00000566457 4997 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 MATR3-232ENST00000502929 4373 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 ZNF334-201ENST00000347606 3890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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HOXD11P31277 ZNF234-201ENST00000426739 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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HOXD11P31277 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 AC008496.1-201ENST00000509131 295 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
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HOXD11P31277 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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HOXD11P31277 DOCK5-201ENST00000276440 10075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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HOXD11P31277 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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HOXD11P31277 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 MIR555-201ENST00000384987 96 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 RPS10P20-201ENST00000494130 463 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 AGBL1-205ENST00000635782 3201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 LINC01427-202ENST00000635258 4566 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD11P31277 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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