Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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