Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXD8P13378 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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