Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SOBPA7XYQ1 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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