Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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USP35Q9P2H5 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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USP35Q9P2H5 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
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USP35Q9P2H5 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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USP35Q9P2H5 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP35Q9P2H5 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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