Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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LHX9Q9NQ69 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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LHX9Q9NQ69 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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LHX9Q9NQ69 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
LHX9Q9NQ69 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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LHX9Q9NQ69 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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LHX9Q9NQ69 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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LHX9Q9NQ69 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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