Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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SGF29Q96ES7 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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SGF29Q96ES7 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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SGF29Q96ES7 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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SGF29Q96ES7 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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SGF29Q96ES7 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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SGF29Q96ES7 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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SGF29Q96ES7 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
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SGF29Q96ES7 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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SGF29Q96ES7 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGF29Q96ES7 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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