Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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