Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
IMPG1Q17R60 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
IMPG1Q17R60 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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