Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
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PTPRNQ16849 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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PTPRNQ16849 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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PTPRNQ16849 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRNQ16849 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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