Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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FXNQ16595 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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FXNQ16595 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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FXNQ16595 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FXNQ16595 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FXNQ16595 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FXNQ16595 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FXNQ16595 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
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FXNQ16595 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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FXNQ16595 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
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FXNQ16595 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FXNQ16595 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FXNQ16595 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FXNQ16595 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FXNQ16595 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FXNQ16595 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FXNQ16595 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FXNQ16595 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FXNQ16595 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
FXNQ16595 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FXNQ16595 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FXNQ16595 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FXNQ16595 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FXNQ16595 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FXNQ16595 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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FXNQ16595 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FXNQ16595 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FXNQ16595 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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