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| FXN | Q16595 | ARID2-205 | ENST00000444670 | 7316 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.36 | □□□□□ -1.71 | | |
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| FXN | Q16595 | ZNF85-201 | ENST00000300540 | 1531 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.35 | □□□□□ -1.71 | | |
| FXN | Q16595 | AC010733.2-201 | ENST00000589496 | 5702 nt | BASIC | 4.35 | □□□□□ -1.71 | | |
| FXN | Q16595 | AC007823.1-201 | ENST00000569932 | 1566 nt | BASIC | 4.35 | □□□□□ -1.71 | | |
| FXN | Q16595 | CDK1-209 | ENST00000614696 | 1884 nt | TSL 5 BASIC | 4.35 | □□□□□ -1.71 | | |
| FXN | Q16595 | PLS3-203 | ENST00000420625 | 3150 nt | TSL 5 BASIC | 4.35 | □□□□□ -1.71 | | |
| FXN | Q16595 | CENPI-201 | ENST00000372926 | 2375 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| FXN | Q16595 | KIFAP3-202 | ENST00000367765 | 4111 nt | TSL 2 BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| FXN | Q16595 | DNAH8-205 | ENST00000449981 | 12940 nt | TSL 5 BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| FXN | Q16595 | RC3H1-201 | ENST00000258349 | 10988 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
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| FXN | Q16595 | Y_RNA.151-201 | ENST00000363566 | 112 nt | BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| FXN | Q16595 | Y_RNA.202-201 | ENST00000364083 | 110 nt | BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
| FXN | Q16595 | RNU6-11P-201 | ENST00000364234 | 107 nt | BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |
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| FXN | Q16595 | RNU6-36P-201 | ENST00000384172 | 107 nt | BASIC | 4.34 | □□□□□ -1.71 | | |