Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNA6Q15825 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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