Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.26
HMGN3Q15651 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
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HMGN3Q15651 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.88□□□□□ -2.27
HMGN3Q15651 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
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