Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNN3Q15417 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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