Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
BRD3Q15059 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
BRD3Q15059 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
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