Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
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SHPRHQ149N8 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SHPRHQ149N8 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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