Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDE1CQ14123 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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