Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARB2Q14108 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms