Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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PKP1Q13835 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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PKP1Q13835 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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PKP1Q13835 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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PKP1Q13835 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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PKP1Q13835 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKP1Q13835 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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