Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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