Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KRR1Q13601 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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