Protein–RNA interactions for Protein: Q13107

USP4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4Q13107 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
USP4Q13107 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
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USP4Q13107 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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USP4Q13107 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP4Q13107 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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USP4Q13107 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP4Q13107 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP4Q13107 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
USP4Q13107 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP4Q13107 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
USP4Q13107 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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