Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
IFT88Q13099 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms