Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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GRIK3Q13003 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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GRIK3Q13003 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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