Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
BPTFQ12830 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
BPTFQ12830 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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