Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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HOXD10P28358 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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HOXD10P28358 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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HOXD10P28358 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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HOXD10P28358 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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HOXD10P28358 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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