Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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PTPRBP23467 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
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PTPRBP23467 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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PTPRBP23467 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
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PTPRBP23467 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
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PTPRBP23467 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
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PTPRBP23467 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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PTPRBP23467 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
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