Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHPF2Q9P2E5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms