Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C11orf49Q9H6J7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms