Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d4aQ9D7V1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh2d4aQ9D7V1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms