Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cstf3Q99LI7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms